大连胃非贲门腺癌新易感基因的鉴定-大连春柳胃肠医院

大连胃非贲门腺癌新易感基因的鉴定

来源:大连春柳胃肠医院时间：2021-08-31 01:30

胃非贲门腺癌新易感基因的鉴定

翻译：王玺

哈尔滨医科大学附属第一医院消化内科

目的

目前，有几项关于非贲门胃癌的全基因组关联研究（GWAS）已经发表，对这些已发表的单个研究的数据进行合并汇总，会挖掘出更多的新的关联信号，这将进一步阐明非贲门胃癌的遗传易感性。

研究方案方法

首先，对两项已发表的中国人群GWAS研究进行了荟萃分析（meta-analysis），包含2031例非贲门胃癌和4970例正常对照样本。第二阶段，对收集到的3564例非贲门胃癌和4637例对照样本进行了基因分型。

结果

整体的荟萃分析显示了两个新的关联信号。第一个关联信号位于5q14.3，标记单核苷酸多态性（SNP）位点为rs7712641（per-allele OR=0.84； 95%CI 0.80~0.88；P=1.21×10^-11），该位点位于长非编码RNA（Lnc-POLR3G-4）内含子区域。与正常组织相比，该RNA在非贲门胃癌组织呈低表达（P_{wilcoxonsigned-rank}=7.20×10^-4）。同时，发现的另外一个新的关联信号位于1q22，标记位点为rs80142782（per-allele OR=0.62； 95%CI 0.56~0.69；P =1.71×10^-19），以往研究曾在该染色体区域发现过另外一个关联位点rs4072037（per-allele OR=0.74；95% CI 0.69~0.79； P =6.28×10^-17），新发现的位点是独立于先前报道的。条件分析表明，新的SNP保持基因组显著（P_conditional=3.47×10^-8）。更为有趣的是，rs80142782在东亚人群中最小等位基因频率为0.05，但在欧洲和非洲人群中呈单态性。